宣德年间（1426—1435年）知府赖瑛建藏书阁，购经史诸书藏之，以便诸生诵读。都督同知沐昂建文昌阁。

    正统八年（1443年）知府徐文振见学宫多处已坏，意欲重修，因财力不足，便与同知刘海、通判彭善道、建水知州潘晋，还有临安卫指挥万僖、王玑、孙友等相商，皆捐俸购材鸠工重修之。工程延续了一些时日，所筹资金用完，适逢云南按擦司副使、金陵人姜竣巡察至临安，也捐俸助修。又逾年，明伦堂、四斋房、大成殿及两庑、戦门、棂星门、杏坛，次第修缮完好，规模焕然一新。这是自元代始建至此160年后较大的一次重修。

    天顺六年（约1462年），知府网佐、同知刘文、知州徐景云、临安卫指挥万僖、镇抚柴庸等，重建杏坛、射圃。王佐将所得孔圣弦诵遗像图刻石，置杏坛内，供人瞻仰。

    成化三年（1467年），知府周瑛、同知白伦、通判林定、推官刘埙等兴工开凿泮池，下湬以石，上乘以桥，历时一年落成。

    成化十五年（1479年），副使何纯、知府薛昌重修学宫。棂星门外为民居所富，何纯购下地皮，将民居迁出。

    弘治八年（1495年），云南按察副使李孟晊、知府王济重修庙学，不数月而成，大成殿、明伦堂宏丽有加。

    弘治九年（1496年），副使李孟晊、知府陈盛重修藏书阁，改名尊经阁，置乐器。

    弘治十二年（1499年）副使王一言、知府王资良拓修文庙，“恢拓方正，而大施修缮，务极宏状，亘其四周，树木内外，巍然焕然，倍徒旧规，甲于列郡。”并浚泮池，广二十亩。同知马谦建射圃、观德亭。

    嘉靖五年（1526年），副使戴书重建景贤祠，“于祠前广易其地，作前后讲堂者二，环以书房，总四十间”，题额曰“寄贤书院”，讲堂一题额“聚奎”，另一题“丽泽”。嘉靖九年（1530年），副使戴书继建启圣祠，并置经籍雅乐，郡人徐澜厘正之。

    嘉靖十三年（1534年），知府姜恩、知州沈常学、教授赵维贤奉诏建乡贤之祠，上状于布政司右使袁傧、督学陈焕等，首祀张隆、邢干、张文宗、田容四人，建祠后就，称四贤祠。

    嘉靖二十年（1541年），副书记蒋宗鲁建名宦祠，将四贤祠改为乡贤祠。

    万历三年（1575年），知府昌应时建文星阁、云路坊于泮池南，题额“滇南邹鲁”。

    万历九年（1581年），知府甘一骥继修两庑。

    万历二十七年（1599年），知府张守刚修两庑。

    万历四十六年（1618年），知府林裕肠于泮池内小岛上建思乐亭，有堤和石板桥与池畔林荫道相连。

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