19世纪末20世纪初，哈尔滨的政治、经济、文化特权被俄、日、英、法、德、意、美、丹等十几个国家的殖民者控制，新兴城市哈尔滨成了殖民者的乐园，这使得一些爱国的有识之士深感忧虑。张学良将军在《哈尔滨文庙碑记》中写到：“民德即离，势必至于家邦陵替，本实先拨，而求枝叶之无伤，胡可得也。”为此，由政府投资和社会捐款73万银元，于1926年至1929年修建了这座东北地区面积最大，建筑等级最高、保存最完好的一座孔庙。

    哈尔滨文庙占地25000余平方米，建筑面积6000余平方米。四周环以黄琉璃瓦顶红墙，布局严谨，错落有致，金碧辉煌，浑然天成。1931年3月23日，哈尔滨文庙举行了首次祭典礼，后来直至哈尔滨解放举行了三十多次祭孔活动。以传统文化来抵制外来文化。1946年哈尔滨解放后，文庙先后用作哈尔滨医专、医科大学校舍和哈尔滨军事工程学院的图书馆、黑龙江省军区后勤仓库。1985年2月26日，经黑龙江省人民政府批准，在文庙成立了黑龙江省民族博物馆，又经1985至1988年三年的重点维修和筹备，于1988年10月正式对外开放。1996年被国务院批准为第四批全国重点文物保护单位。

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