清雍正元年（1723）彰化设县，雍正4年（1726）知县张镐倡建县儒学，建学立师，以彰雅化，当时的县儒学即今彰化孔庙。清乾隆16年（1751）士绅施士龄等人倡议重修，各方捐资响应，知县程运青具情以报，准予重修，后因故中辍，至乾隆18年（1753）由知县王鸮主持重修工事，但由于资金缺乏，重修范围仅止于大成门。

    清乾隆23年（1758），彰化孔庙倾颓，知县张世珍再倡议重修，以砖砌甬道，移礼门、义路于大成门左右，并在门外设置泮池与照墙，于泮池题石曰：“芹泉”，取“泮水采芹”之意。明伦堂依原址一并重修，地基增高二尺，规模宏敞。明伦堂之后新建训导署，训导署左方建教谕署，孔庙的规模俱全。此次重修工程自乾隆24年（1759）10月兴工，乾隆25年（1760）5月完工。

    清乾隆51年（1786）林爽文事件，彰化县城遭兵燹之灾，彰化孔庙的明伦堂与学署毁于战乱。清嘉庆2年（1797）贡生郑士模倡议重修孔庙，工程因故并未完成。直至嘉庆16年（1811）知县杨桂森倡议重修，增建大成殿前露台石栏杆，自东、西两庑至大成门，增建短垣，于泮池上新建“登瀛桥”，毁于战乱的明伦堂则改建至孔庙的左侧。知县杨桂森并置礼乐器，招佾舞生，于春秋二季举行祀典。嘉庆17年（1812）职员王松修泮池，嘉庆21年（1816）吴性诚在明伦堂旧址兴建文昌祠并重修白沙书院。

    清道光5年（1825）教谕蔡克全刻卧碑石，置明伦堂的左侧，又建福德祠于明伦堂大门内侧。道光10年（1830）知县李廷壁倡议重修夫子庙，编修县志，并由接任知县托克通阿力劝地方士绅，商贾踊跃捐资，募得资金一万余元。

    清道光11 年（1831）李廷壁知县回任，乃于彰化孔庙明伦堂后方开辟静室，鸠工庀材，重修夫子庙。此次重修，将基地垫高二尺二寸，殿前改用龙柱二支及石柱二十支，露台亦增高二尺二寸，崇圣祠旁增设名宦祠与乡贤祠及礼器库、乐器库，道光11年的重修，历时二年七月，奠定今日孔庙的规模与格局。

    清光绪4年（1878）知县傅端铨见圣庙倾颓，乃捐廉养银倡义重修，并得到士绅张春华等人，急公好义，相继捐资，孔庙建筑得以焕然一新，至光绪5年（1879）完成孔庙的修护。

    1897年日人将鹿港国语传习所迁移至彰化，当时于孔庙做为上课的场所，至明1898年10月1日废止，国语传习所改设立“彰化公学校”，直至1915年才搬离孔庙。日治时期因市区改正，拆照墙并将泮池填平，拓宽东门大通（今孔门路），做为通往彰化神社的道路。

    1933年孔庙戟门及大成门受风雨侵袭而颓圮，幸经市民李程慷慨捐资一千圆，并倡议募款修护，总计募得一千九百六十五圆，不足费用由孔庙存款支应，孔庙管理人李崇礼鸠工庀材，负责修护工程，恢复大成门与戟门旧貌。

    1952年士绅吴上花等人请彰化县长陈锡卿向省政府商请补助，重修孔庙。1971年彰化县政府有意将孔庙拆除，迁建至八卦山上，经地方人士异议而作罢，1978年重修，1983年12月28日彰化文庙被指定为台湾第一级古迹。

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