吉林市地处东北内陆，最早为古扶余王国的前期都城，距今2200余年。扶余王国、高句丽王国曾先后在此建立军事城堡。但是，由于交通不便、民族迁移等原因，吉林地区一直没有建城设府，直到清康熙十二年（1637年），宁古塔副都统安珠瑚才在此修建木城，设置政府机构。因此，乾隆元年（1736年）以前，吉林地区并未出现正规的文庙释奠，流放东北的儒生只能在家中或者私人书院中释奠孔子。吉林文庙建成后，按照清政府制定的规条，开始正式祭祀先师孔子。具体规条有：
顺治元年，定每岁春秋仲月上丁日，直省、府、州、县各行释奠于先师之礼。以地方正印官主祭，陈设礼仪，均与国子监丁祭同。
顺治初年，定直省、府、州、县建名宦、乡贤二祠于学宫内，每岁春秋释奠先师。同日以少牢祀名宦、乡贤，皆地方官主祭行礼。
康熙二十五年议准，直省武官协领、副将以上，遇文庙祭祀，并令配祀行礼。
康熙五十年题准，我朝乐章，皆用平字。因州县未曾颁发，仍袭前明，错用和字，著直省各巡抚通行府、州、县儒学，皆改和字为平字，以归画一。
雍正二年准议，大成殿四配、十二哲，每位一案，两庑二位共一案。崇圣祠四配异案，两庑二位共案。其两庑内有单位者，仍独设一案。
雍正三年奏准，将文庙祭器、乐器式样，刊刻颁行直隶各省，画一制造。
雍正五年议准，致祭至圣先师孔子，大典攸关。今直省惟司道、府、州、县官于丁日行礼。其督抚、学政则先期一日于阶下行九叩礼，谓之祭丙，典制所无。且行礼前后，仪期涤器、视牲、晋爵、奠斝、仪文隆备。今但行九叩礼，亦未允协。嗣后，省会之区每遇春秋二季，于上丁日，督抚、学政率司道、府、州、县等官，齐集致祭，如学政考试，各府即于考试处文庙内行礼。至各府、州、县守土正印官，率领各属员亦于上丁日行礼。毋得简率从事，均照典制遵行。
雍正十二年议准，直省文庙祭器、乐器有未全备者，该地方官详明督抚，照额设原数备齐。如有损坏，亦即详明修备。府、州、县官并教官离任时，俱各查明交代。如有损坏遗失之处，或教官已经详报而该地方官不行修整，责令该地方官赔修。如教官未经详报，即著教官赔修。
乾隆元年议准，凡文庙祭器、乐器有未制备者，均动项成造，仍于完竣时报部核销。
乾隆六年议准，学宫从祀先贤、先儒神位次序，以京师太学成式，通行直省、府、州、县遵照。画题按东西先后次序安设。
乾隆八年，钦定圣庙乐章，颁发曲阜及天下学。今乐舞生肄习处肃将事。
乾隆九年议准，直省文武大员及各属正印官于朔望文庙行香礼毕之后，应亲诣崇圣祠行礼。或有事不能亲诣，即委令教官敬谨行礼。
乾隆十六年议准，直省文庙春秋丁祭，准设礼生四名，皆以生员充设。
乾隆三十七年议准，盛京学宫每岁春秋祭祀沿用民间鼓乐，于文庙定制有违，令该府尹等将需用乐舞等器，按照钦定皇朝礼器，如式制造。其额设乐舞生，照阙里之例，酌选稍通音律者，送太常寺肄业。俟熟谙时，咨回本学，令其转相传授。
乾隆三十七年议准，各省、府、州、县建先师孔子庙，每岁以春秋仲月上丁日释奠，省城以巡抚为正献，有总督省分，总督正献。两序以布政使、按察使及道员，两庑以知府、同知为分献。崇圣祠，以学政为正献，府、州、县无道员分驻者，知府、知州、知县正献。两序以佐贰及所属，两庑以廪生分献。崇圣祠，教谕正献，两序，训导分献，两庑廪生分献。
按照清朝政府颁发的《会典事例》和《学政全书》中关于文庙祀典的规定，吉林文庙建成后即开始依律施行吉林文庙祀典。
1、神位：
至圣先师孔子神位，南向，木主高二尺五寸五分，广六寸五分，厚一寸，朱地金书。小座高四寸五分，大座高一尺四寸五分，龛二重；
四配神位，木主高一尺七寸，广四寸五分，厚五分，赤地金书。小座高三寸五分，大座高一尺五分，东西连二龛合座；
十二哲神位，木主高一尺四寸，广三寸五分，厚五分，赤地金书。小座高二寸五分，大座高一尺，东西各连六龛合座；
两庑从祀先贤、先儒神位，木主高一尺三寸六分，广三寸五分，厚六分，赤地墨书。小座高二寸，大座高七寸五分，东西各连四龛；
崇圣祠五王神位，皆南向。木主高一尺七寸，广四寸五分，厚五分，赤地金书。正位五龛中独座，左右两龛合座；
崇圣祠四配神位。木主高一尺四寸，广三寸五分，厚五分，赤地金书。东西连二龛合座。今增孟皮氏于颜氏之上，一龛独座；
崇圣祠两庑从祀神位：木主高一尺三分六寸，广三寸五分，厚六分，赤地墨书。东连二龛一座。（连二龛，谓一龛中分为二，各一座也。）独龛一座，西连二龛一座。
2、奉祀：
正殿主位：至圣先师孔子
正殿东配：复圣颜子、述圣子思子
正殿西配：宗圣曾子、亚圣孟子
正殿东哲：先贤闵子、先贤冉子、先贤瑞木子、先贤仲子、先贤卜子、先贤有子
正殿西哲：先贤冉子、先贤宰子、先贤冉子、先贤言子、先贤颛孙子、先贤朱子
东庑先贤：公孙侨、林放、原宪、南宫适、商瞿、漆雕开、司马耕、梁鳣、冉儒、伯虔、冉季、漆雕徒父、漆雕哆、公西赤、任不齐、公良孺、公肩定、鄡单、罕父黑、荣旗、左人郢、郑国、原亢、廉洁、叔仲会、公西舆如、邽巽、陈亢、琴张、步叔乘、秦非、颜哙、颜何、县亶、牧皮、乐正克、万章、周敦颐、程颢、邵雍（共四十名）
西庑先贤：蘧瑗、澹台灭明、宓不齐、公冶长、公皙哀、高柴、樊须、商泽、巫马施、颜辛、曹恤、公孙龙、秦商、颜高、壤驷赤、石作蜀、公夏首、后处、奚容蒧、颜祖、勾井疆、秦祖、县成、公祖句兹、燕伋、乐欬、狄黑、孔忠、公西蒧、颜之仆、施之常、申枨、左邱明、秦冉、公明仪、公都子、公孙丑、张载、程颐（共三十九名）
东庑先儒：公羊高、伏胜、毛亨、孔安国、后苍、许慎、郑康成、范甯、陆贽、范仲淹、欧阳修、司马光、谢良佐、罗从彦、李纲、张栻、陆九渊、陈淳、真德秀、何基、文天祥、赵复、金履祥、陈澔、方孝孺、薛瑄、胡居仁、罗钦顺、吕丹、刘宗周、孙奇逢、张屐祥、陆陇其、张伯行（共三十四名）
西庑先儒：谷梁赤、高堂生、董仲舒、刘德、毛苌、杜子春、诸葛亮、王通、韩愈、胡瑗、韩琦、杨时、游酢、尹焞、胡安国、李侗、吕祖谦、袁焱、黄干、辅广、蔡沈、魏了翁、王柏、陆秀夫、许衡、吴澄、许谦、曹端、陈献章、蔡清、王守仁、吕坤、黄道周、陆世仪、汤斌（共三十五名）
崇圣祠主位（五世祖）：肇圣王木金父公、裕圣王祈父公、诒圣王防父公、昌圣王伯夏公、启圣王叔梁公
崇圣祠东配先贤：孔孟皮、颜无繇、孔鲤
崇圣祠西配先贤：曾点、孟孙激
崇圣祠东庑先儒：周辅成、程珦、蔡元定
崇圣祠西庑先儒：张迪、朱松
3、陈设：
先师正位前制：帛一，色白。设案一，牛一、羊一、豕一，实以太羹。铏二，实以和羹。簋二，实以黍、稷。簠二，实以稻、梁。笾十，实以形盐、藁鱼、枣、粟、榛、菱、芡、鹿脯、白饼、黑饼。豆十，实以韭菹、醯醢、青菹、鹿醢、芹菹、兔醢、笋菹、鱼醢、脾析、豚拍。尊一、爵三、鑪一、鐙二。
四配位前制：帛各一，色白。各设案一，陈羊一、豕一，实以太羹。铏二，实以和羹。簋二，实以黍、稷。簠二，实以稻、梁。笾八，实以形盐、藁鱼、枣、粟、榛、菱、芡、鹿脯。豆八，实以韭菹、醯醢、青菹、鹿醢、芹菹、兔醢、笋菹、鱼醢。爵三、鑪一、鐙二，东西各尊一。
十二哲位前制：帛各一，色皆白。东西各设六案，铏一，实以和羹。簋一，实以黍。簠一，实以稷。笾四，实以形盐、枣、粟、藁鱼。豆四，实以青菹、鹿醢、芹菹、兔醢。爵三，东西各羊一、豕一。尊一、鑪一、鐙二。
两庑位前制：二位共一案，每案陈铏一，实以和羹。簋一，实以黍。簠一，实以稷。笾四，实以形盐、枣、粟、藁鱼。豆四，实以青菹、鹿醢、芹菹、兔醢。先贤案前，东西各羊二、豕二。先儒案首，东西各羊一、豕一。东西各尊三，统设香案二，每案制：帛一，爵三，鑪一、鐙二。
崇圣祠正位前：五案，各帛一、羊一、豕一，实以太羹。铏二，实以和羹。簋二，实以黍、稷。簠二，实以稻、梁。笾八，实以形盐、藁鱼、枣、粟、榛、菱、芡、鹿脯。豆八，实以韭菹、醯醢、青菹、鹿醢、芹菹、兔醢、笋菹、鱼醢。爵三、尊一、鑪一、鐙二。
崇圣祠配位前：凡五案，各帛一，铏一，实以和羹。簋一，实以黍。簠一，实以稷。笾四，实以形盐、枣、粟、藁鱼。豆四，实以青菹、鹿醢、芹菹、兔醢。东西各羊一、豕一、尊一、鑪一、鐙二。
两庑位前：东二案，西一案，案设爵一、簠、簋各一、笾、豆各一。东西各帛一、羊一、豕一、尊一、鑪一、鐙二。（以上俱会典事例三百三十四）
4、乐器：
麾一、编钟十六、编磬十六、琴六、瑟四、排箫二、箫六、笛六、篪四、笙六、埙二、建鼓一、搏拊二、柷一、敔一、节二、羽三十六、龠三十六。奏昭平、宣平、秩平、叙平、懿平、德平之章，陈六佾之舞。二月以夹鈡为宫，八月以南吕为宫。（会典三十四）
5、乐章：
迎神，奏昭平一成：大哉孔子，先觉先知。与天地参，万世之师。祥徵麟绂，韵答金丝。日月既揭，乾坤清夷。
奠帛初献，奏宣平一成：予怀明德，玉振金声。生民未有，展也大成。俎豆千古，春秋上丁。清酒既载，其香始升。
亚献，奏秩平一成：式礼莫愆，升堂再献。乡协鼓镛，诚孚垒甗。肃肃雍雍，誉髦斯彦。礼陶乐淑，相观而善。
终献，奏叙平一成：自古在昔，先民有作。皮弁祭菜，於伦思乐。维天牖民，维圣时若。彝伦攸叙，至今木铎。
撤馔，奏懿平一成：先师有言，祭则受福。四海黉宫，畴敢不肃。礼成告彻，毋疏毋渎。乐所自生，中原有菽。
送神，奏德平一成：凫绎峩峩，洙泗洋洋。景行行止，流泽无疆。聿昭祀事，祀事孔明。化我蒸民，育我胶庠。
6、仪注：
祭之前二日，承祭分献官皆致斋，执事官补服，至牺牲所省牲。
前一日，承祭官率僚属朝服上香，监视宰牲，执事者举祝案送至斋所，承祭官视毕，送至前后殿安设，一跪三叩，退。
祭日，日出前六刻，承祭等官更衣毕，通赞赞：“启户。乐舞生登歌，执事者各执其事，文舞六佾进，承祭官就位，分献官就位，陪祭官就位。瘗毛血，启牲馔盖，举迎神乐，奏昭平之章。”司香捧香盘。赞引承祭官升东阶，入殿左门，诣先师香案前。司香跪进香。赞：“上香。”承祭官上炷香。次三上瓣香，跪一叩，兴。赞：“复位。”分献官各诣四配、十二哲、两庑先贤、先儒位，上香如仪。皆复位。通赞赞：“跪，叩，兴。”承祭官行三跪九叩礼，各官随行礼，兴。赞：“奠帛。行初献礼，奏宣平之章，舞羽龠之舞。”引赞，引承祭官诣盥洗所，浴水进巾。司帛奉帛，司爵奉爵进。承祭官入殿左门，诣先师位前跪，一叩，兴，司帛跪奉篚，承祭官受篚，拱举奠于案。司爵跪奉爵，承祭官受爵，拱举奠于正中。跪，一叩，兴，复位。分献官各诣四配、十二哲、两庑殿献如仪。各复位。司祝至祝案前跪，三叩，奉祝版跪案左，乐止。承祭官诣读祝位，跪，众官皆跪。司祝读祝毕，捧祝版诣正位，跪，安于案，三叩，退。承祭官三叩，兴，复位。行亚献礼，奏秩平之章，行终献礼，奏叙平之章。承祭、分献并如初献仪。乃饮福受胙。承祭官诣饮受位前，跪饮福酒，受福胙，三叩，兴，复位。舞文德之舞，退。乃撤馔，奏懿平之章。撤毕，送神，奏德平之章。承祭及众官行三跪九叩礼。执事者奉祝，次帛，次馔，次香，恭送燎所。各官避立西旁东面，俟过复位，引诣望燎位，望燎毕，阖户各退。
崇圣祠同时致祭。赞：“引。”引承祭官入祠左门，分献官随入，承祭官盥洗毕，引诣殿阶下正中，分献官以次序立于后，均北面。典仪赞：“执事官各共迁职。”赞：“引官。”赞：“就位。”引承祭官就拜位，立。赞：“迎神。”司香捧香盘进。赞：“引官。”赞：“就上香位。”引承祭官升东阶，由殿左门入，诣肇圣王香案前，立，司香跪，奉香。赞：“跪。”承祭官跪，一叩。赞：“上香。”承祭官上炷香，次三上瓣香，一叩。兴，以次诣左右正位前上香。仪同。赞：“复位。”引承祭官退至殿左门北面，揖出，复位。分献官各诣配位、两庑，从祀位前上香如仪，皆复位。赞：“引官。”赞：“跪、叩、兴。”承祭官行三跪九叩礼，分献官均随行礼，奠帛，行初献礼。执事生各奉篚执爵进。承祭官入殿左门，诣神位前，跪，一叩。司帛跪奉篚，承祭官受篚，拱举奠于案。司爵跪奉爵，承祭官受爵，拱举奠于正中，一叩，兴。以次奠献毕。司祝至案前三叩，奉祝版跪案左。承祭官诣读祝位，跪。司祝读祝文毕，诣正中神位前跪，安于案，三叩，退。承祭官行三叩礼毕，仍由殿左门出，复位。分献官奠帛，献爵，各如仪，皆复位次。亚献奠爵于左，次、终献奠爵于右，配位、两庑毕献仪均与初献同。撤馔、送神，承祭官及分献官均行三跪九叩礼。执事生奉祝，次帛，次馔，次香，恭随燎所。承祭官避立西旁，东面，俟祝帛过后，复位。引诣望燎位望燎，引承祭官退。
7、祝文：
维某年月日，某官某至祭于至圣先师孔子曰：维先师德隆千圣，道冠百王。揭日月以常行，自生民所未有。属文教昌明之会，正礼和乐节之时。辟雍钟鼓，咸恪荐于馨香。泮水胶庠，益致严于笾豆。兹当春（秋）仲，祗率彝章。肃展微忱，聿将祀典。以复圣颜子、宗圣曾子、述圣子思子、亚圣孟子配，尚飨。（祀典考五）
维某年月日，某官某致祭于肇圣王、裕圣王、诒圣王、昌圣王、启圣王曰：维王奕业鈡祥，光开圣绪。圣德之后，积久弥昌。凡声教所覃敷，率循源而溯本。宜肃明禋之典，用申守土之忱。兹届仲，春（秋）聿修祀事。配以先贤孟皮氏、先贤颜氏、先贤曾氏、先贤孔氏、先贤孟孙氏，尚飨。（祀典考五）
吉林文庙祀典的举行，保证了在清代龙兴之地生活的满族贵胄和吉林地方官员有更多的机会接触儒学，从而进一步了解儒学思想和地方儒学的实际发展情况，这对地方儒学发展是非常有利的。在当时吉林儒学或书院发展困难，学舍稀少的情况下，满族贵胄和吉林地方官员在祀典时能直接发现儒学或书院的运行情况，尽快帮助儒学发展，进而推动了吉林地方兴学重教之风的兴起。
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