明清时期，随着民族英雄郑成功将台湾收回祖国的怀抱、大陆移民纷纷赴台拓垦和统治阶级对台湾的加强管理，儒学也随之进入了台湾，并对台湾的社会及文化教育产生了重大的影响。有 “全台首学”之称的台南孔庙落成于明永历二十年（1666年），是全台湾建成的第一座孔庙，也是郑成功收复台湾后在台湾建立的第一所高等学府，因为在此之前，台湾没有任何比较正规的中国文化教育设施（比如私塾、学校之类的），因此，台南孔庙的建立标志着儒学正式进入了台湾，成为台湾教育发展史上的一个重要里程碑。它掀开了台湾教育史的崭新的一页，中华传统文化及教育由此在台湾岛上传播开来。